Начальник Института
генерал-майор Щеблыкин Виктор Николаевич, доктор экономических наук, профессор.
Начальник Голицынского пограничного института Федеральной службы безопасности Российской Федерации с 2019 года.
Начальник филиала Института (г. Ставрополь)
полковник Кунаковский Анатолий Иванович.
Начальник филиала Голицынского пограничного института Федеральной службы безопасности Российской Федерации с 2008 года.